На 23.12.1993 г. на своя сесия Общински съвет-община Елин Пелин взема решение за предложение пред МОНК за обособяване на самостоятелно начално училище в Гара Елин Пелин за учениците от I до IV клас,живеещи южно от железопътната линия.С решение № РД 14-28/20.05.1994 г. обнародвано в ДВ брой 45 от 3 юни 1994 г. училището е открито.От 01.07.1994 г. за временно изпълняващ длъжността директор, поради липса на други кандидати е назначен Благой Цонев Цонев дългогодишен начален учител.В кратко време той успява да организира работата по подготовка на училището и и новата учебна година.Името на училището „Отец Паисий“ е прието с абсолютно мнозинство от присъстващите кметски съветници.Много са доброжелателите дали своя дял за изграждане на базата на училището.Дълъг е техния списък.

На 15.09.1994 г. е открито официално училището и новата учебна година.

Първи учители са :Благой Цонев,Зорка Цонева,Радка Андреева-възпитател на I клас,Богданка Симеонова – възпитател на II клас-все редовни учители.Училището работи по I вариант- целодневен режим.И така учебната 1994 /1995 година завърши успешно за всички 42 ученика които преминаха в по-горен клас без поправителни изпити.С оглед нарасналия брой ученици са обявени още 5 вакантни места – 2-ма учители и 3-ма възпитатели.